Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frat1P70339 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frat1P70339 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frat1P70339 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frat1P70339 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frat1P70339 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frat1P70339 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frat1P70339 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Frat1P70339 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frat1P70339 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frat1P70339 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms