Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms