Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps18P62270 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps18P62270 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms