Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms