Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csrnp1P59054 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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