Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Dpf3P58269 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Dpf3P58269 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Dpf3P58269 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dpf3P58269 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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