Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpa1P57784 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms