Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TdgP56581 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TdgP56581 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TdgP56581 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TdgP56581 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TdgP56581 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TdgP56581 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TdgP56581 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TdgP56581 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms