Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CartptP56388 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms