Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacnb3P54285 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms