Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa6P50704 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa6P50704 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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