Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpdP50404 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms