Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms