Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syt1P46096 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms