Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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