Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TfamP40630 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TfamP40630 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TfamP40630 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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