Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms