Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms