Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin1P35438 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms