Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptk2P34152 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptk2P34152 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptk2P34152 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms