Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd1P33215 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms