Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Notch4P31695 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Notch4P31695 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms