Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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