Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aco1P28271 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms