Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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