Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Xrcc5P27641 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Xrcc5P27641 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Xrcc5P27641 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Xrcc5P27641 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc5P27641 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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