Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms