Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pde6bP23440 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pde6bP23440 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pde6bP23440 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pde6bP23440 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pde6bP23440 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pde6bP23440 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6bP23440 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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