Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms