Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PparaP23204 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PparaP23204 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PparaP23204 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PparaP23204 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms