Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RarbP22605 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RarbP22605 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms