Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
P20040 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P20040 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P20040 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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