Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NefhP19246 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NefhP19246 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms