Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18533 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18533 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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