Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18525 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18525 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18525 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18525 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18525 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18525 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18525 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18525 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18525 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms