Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms