Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms