Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms