Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms