Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamp1P11438 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms