Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms