Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P10404 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P10404 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P10404 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P10404 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms