Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccl2P10148 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms