Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms