Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb7P09024 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms