Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms