Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnfP06804 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnfP06804 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnfP06804 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TnfP06804 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TnfP06804 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms