Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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