Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cops6O88545 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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