Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms